Este artigo relata o levantamento das principais dificuldades enfrentadas no processo de ensino aprendizagem em Química, em turmas do Ensino Médio do Instituto de Educação Rui Barbosa, mediante dados coletados por observação in loco. Pesquisas desse tipo contribuem de forma significativa para a formação de professores, visto que iniciativas capazes de promover a contextualização e interdisciplinaridade são meios eficazes para a realização de uma prática pedagógica comprometida com a formação crítica do cidadão.